Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U2

TSSC4, Protein TSSC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSC4Q9Y5U2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSC4Q9Y5U2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms