Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHLDA3Q9Y5J5 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms