Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
KNSTRNQ9Y448 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms