Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF330Q9Y3S2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms