Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y251

HPSE, Heparanase, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPSEQ9Y251 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPSEQ9Y251 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPSEQ9Y251 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPSEQ9Y251 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPSEQ9Y251 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPSEQ9Y251 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HPSEQ9Y251 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HPSEQ9Y251 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HPSEQ9Y251 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HPSEQ9Y251 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HPSEQ9Y251 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HPSEQ9Y251 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
HPSEQ9Y251 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPSEQ9Y251 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms