Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF9BQ9UPX0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF9BQ9UPX0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms