Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV0

CEP164, Centrosomal protein of 164 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP164Q9UPV0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CEP164Q9UPV0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CEP164Q9UPV0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CEP164Q9UPV0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CEP164Q9UPV0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CEP164Q9UPV0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CEP164Q9UPV0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CEP164Q9UPV0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CEP164Q9UPV0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CEP164Q9UPV0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CEP164Q9UPV0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CEP164Q9UPV0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CEP164Q9UPV0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CEP164Q9UPV0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CEP164Q9UPV0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CEP164Q9UPV0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CEP164Q9UPV0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CEP164Q9UPV0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CEP164Q9UPV0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CEP164Q9UPV0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
CEP164Q9UPV0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CEP164Q9UPV0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CEP164Q9UPV0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CEP164Q9UPV0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CEP164Q9UPV0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CEP164Q9UPV0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CEP164Q9UPV0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CEP164Q9UPV0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CEP164Q9UPV0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CEP164Q9UPV0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CEP164Q9UPV0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CEP164Q9UPV0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CEP164Q9UPV0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CEP164Q9UPV0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CEP164Q9UPV0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CEP164Q9UPV0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CEP164Q9UPV0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CEP164Q9UPV0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CEP164Q9UPV0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CEP164Q9UPV0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CEP164Q9UPV0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CEP164Q9UPV0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CEP164Q9UPV0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
CEP164Q9UPV0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CEP164Q9UPV0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms