Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMG5Q9UPR3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms