Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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