Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULH4

LRFN2, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN2Q9ULH4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRFN2Q9ULH4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRFN2Q9ULH4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRFN2Q9ULH4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRFN2Q9ULH4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRFN2Q9ULH4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRFN2Q9ULH4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRFN2Q9ULH4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRFN2Q9ULH4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRFN2Q9ULH4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRFN2Q9ULH4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRFN2Q9ULH4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
LRFN2Q9ULH4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRFN2Q9ULH4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRFN2Q9ULH4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LRFN2Q9ULH4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRFN2Q9ULH4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRFN2Q9ULH4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRFN2Q9ULH4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRFN2Q9ULH4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRFN2Q9ULH4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRFN2Q9ULH4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LRFN2Q9ULH4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRFN2Q9ULH4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRFN2Q9ULH4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRFN2Q9ULH4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRFN2Q9ULH4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRFN2Q9ULH4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRFN2Q9ULH4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRFN2Q9ULH4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRFN2Q9ULH4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRFN2Q9ULH4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRFN2Q9ULH4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRFN2Q9ULH4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms