Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GJD2Q9UKL4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJD2Q9UKL4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms