Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPUSD1Q9UJJ7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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