Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms