Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M7

CGN, Cingulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNQ9P2M7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms