Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL42Q9P2K6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms