Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL9Q9P2J3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms