Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGSF9Q9P2J2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGSF9Q9P2J2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGSF9Q9P2J2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGSF9Q9P2J2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGSF9Q9P2J2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGSF9Q9P2J2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGSF9Q9P2J2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGSF9Q9P2J2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGSF9Q9P2J2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGSF9Q9P2J2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGSF9Q9P2J2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGSF9Q9P2J2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGSF9Q9P2J2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGSF9Q9P2J2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGSF9Q9P2J2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGSF9Q9P2J2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGSF9Q9P2J2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGSF9Q9P2J2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGSF9Q9P2J2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGSF9Q9P2J2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGSF9Q9P2J2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGSF9Q9P2J2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGSF9Q9P2J2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGSF9Q9P2J2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGSF9Q9P2J2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGSF9Q9P2J2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGSF9Q9P2J2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGSF9Q9P2J2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGSF9Q9P2J2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGSF9Q9P2J2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGSF9Q9P2J2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGSF9Q9P2J2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGSF9Q9P2J2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGSF9Q9P2J2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGSF9Q9P2J2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGSF9Q9P2J2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGSF9Q9P2J2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGSF9Q9P2J2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGSF9Q9P2J2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGSF9Q9P2J2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGSF9Q9P2J2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGSF9Q9P2J2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
IGSF9Q9P2J2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGSF9Q9P2J2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGSF9Q9P2J2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGSF9Q9P2J2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
IGSF9Q9P2J2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGSF9Q9P2J2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGSF9Q9P2J2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGSF9Q9P2J2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGSF9Q9P2J2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
IGSF9Q9P2J2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
IGSF9Q9P2J2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
IGSF9Q9P2J2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGSF9Q9P2J2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGSF9Q9P2J2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGSF9Q9P2J2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGSF9Q9P2J2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGSF9Q9P2J2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGSF9Q9P2J2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGSF9Q9P2J2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGSF9Q9P2J2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGSF9Q9P2J2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGSF9Q9P2J2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGSF9Q9P2J2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGSF9Q9P2J2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGSF9Q9P2J2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGSF9Q9P2J2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGSF9Q9P2J2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGSF9Q9P2J2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF9Q9P2J2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF9Q9P2J2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF9Q9P2J2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF9Q9P2J2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF9Q9P2J2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF9Q9P2J2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF9Q9P2J2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF9Q9P2J2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF9Q9P2J2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF9Q9P2J2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF9Q9P2J2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF9Q9P2J2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF9Q9P2J2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF9Q9P2J2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF9Q9P2J2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF9Q9P2J2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF9Q9P2J2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF9Q9P2J2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF9Q9P2J2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF9Q9P2J2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF9Q9P2J2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF9Q9P2J2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF9Q9P2J2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF9Q9P2J2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF9Q9P2J2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF9Q9P2J2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF9Q9P2J2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF9Q9P2J2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF9Q9P2J2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms