Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHRF1Q9P1Y6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms