Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX00

TMEM160, Transmembrane protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM160Q9NX00 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM160Q9NX00 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM160Q9NX00 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM160Q9NX00 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM160Q9NX00 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM160Q9NX00 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM160Q9NX00 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM160Q9NX00 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM160Q9NX00 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM160Q9NX00 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM160Q9NX00 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM160Q9NX00 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM160Q9NX00 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM160Q9NX00 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM160Q9NX00 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM160Q9NX00 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM160Q9NX00 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM160Q9NX00 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM160Q9NX00 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM160Q9NX00 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM160Q9NX00 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM160Q9NX00 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM160Q9NX00 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM160Q9NX00 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM160Q9NX00 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM160Q9NX00 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM160Q9NX00 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM160Q9NX00 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM160Q9NX00 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM160Q9NX00 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM160Q9NX00 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM160Q9NX00 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM160Q9NX00 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM160Q9NX00 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM160Q9NX00 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM160Q9NX00 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM160Q9NX00 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM160Q9NX00 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM160Q9NX00 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM160Q9NX00 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM160Q9NX00 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM160Q9NX00 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM160Q9NX00 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM160Q9NX00 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM160Q9NX00 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM160Q9NX00 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM160Q9NX00 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM160Q9NX00 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM160Q9NX00 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM160Q9NX00 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM160Q9NX00 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM160Q9NX00 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM160Q9NX00 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM160Q9NX00 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM160Q9NX00 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM160Q9NX00 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM160Q9NX00 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM160Q9NX00 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM160Q9NX00 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM160Q9NX00 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM160Q9NX00 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM160Q9NX00 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM160Q9NX00 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM160Q9NX00 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM160Q9NX00 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM160Q9NX00 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM160Q9NX00 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM160Q9NX00 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM160Q9NX00 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM160Q9NX00 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM160Q9NX00 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM160Q9NX00 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM160Q9NX00 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM160Q9NX00 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM160Q9NX00 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM160Q9NX00 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM160Q9NX00 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM160Q9NX00 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM160Q9NX00 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM160Q9NX00 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM160Q9NX00 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM160Q9NX00 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM160Q9NX00 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM160Q9NX00 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM160Q9NX00 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM160Q9NX00 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM160Q9NX00 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM160Q9NX00 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM160Q9NX00 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM160Q9NX00 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM160Q9NX00 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM160Q9NX00 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM160Q9NX00 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM160Q9NX00 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM160Q9NX00 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM160Q9NX00 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM160Q9NX00 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM160Q9NX00 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM160Q9NX00 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM160Q9NX00 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms