Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PARVAQ9NVD7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms