Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNTG1Q9NSN8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms