Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT84Q9NSB2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
KRT84Q9NSB2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
KRT84Q9NSB2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KRT84Q9NSB2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KRT84Q9NSB2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KRT84Q9NSB2 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
KRT84Q9NSB2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT84Q9NSB2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms