Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERINC1Q9NRX5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms