Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms