Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms