Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
BATF3Q9NR55 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms