Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR16

CD163L1, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M160, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163L1Q9NR16 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CD163L1Q9NR16 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms