Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
INCENPQ9NQS7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms