Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG4

PCDH12, Protocadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH12Q9NPG4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
PCDH12Q9NPG4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCDH12Q9NPG4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms