Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TUFT1Q9NNX1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms