Protein–RNA interactions for Protein: Q9H173

SIL1, Nucleotide exchange factor SIL1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIL1Q9H173 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIL1Q9H173 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms