Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0L4

CSTF2T, Cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF2TQ9H0L4 TRAF7-206ENST00000569686 586 ntTSL 224.07■■□□□ 1.444e-7■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.094e-7■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.314e-7■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 TRAF7-202ENST00000564067 874 ntTSL 317■□□□□ 0.314e-7■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.164e-7■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 FAM171A2-202ENST00000588067 964 ntTSL 522.88■■□□□ 1.255e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 FRMD8-209ENST00000533782 677 ntTSL 522.38■■□□□ 1.175e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 FRMD8-205ENST00000526201 568 ntTSL 521.53■■□□□ 1.045e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.015e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.935e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 FAM171A2-204ENST00000592560 758 ntTSL 220.46■□□□□ 0.875e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 ACSS2-205ENST00000467019 504 ntTSL 420.29■□□□□ 0.845e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 FRMD8-206ENST00000528854 572 ntTSL 220.15■□□□□ 0.825e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 ACSS2-213ENST00000480978 844 ntTSL 219.72■□□□□ 0.755e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.685e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.635e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.585e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 ACSS2-211ENST00000477932 2450 ntTSL 518.67■□□□□ 0.585e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.585e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.495e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 NOC2L-205ENST00000487214 865 ntTSL 318.02■□□□□ 0.485e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.8■□□□□ 0.445e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 CFL1-205ENST00000526975 567 ntTSL 317.71■□□□□ 0.435e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.415e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.395e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 ACSS2-210ENST00000476922 1527 ntTSL 217.26■□□□□ 0.355e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.345e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 CFL1-215ENST00000534784 737 ntTSL 317.13■□□□□ 0.335e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.315e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.89■□□□□ 0.295e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.285e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.235e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.235e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 PLXNB2-205ENST00000432455 1620 ntTSL 516.41■□□□□ 0.224e-7■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.23e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.165e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.135e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.115e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.075e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 FAM214A-203ENST00000534964 4590 ntTSL 215.34■□□□□ 0.053e-9■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 CERCAM-207ENST00000463535 1205 ntTSL 1 (best)15.19■□□□□ 0.025e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 CFL1-210ENST00000530945 1509 ntTSL 215.12■□□□□ 0.015e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.015e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -05e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 CHCHD3-204ENST00000457942 559 ntTSL 414.92□□□□□ -0.025e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.035e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.065e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 CXorf40B-206ENST00000483447 808 ntTSL 514.65□□□□□ -0.065e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 STAG2-215ENST00000469481 989 ntTSL 314.52□□□□□ -0.095e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.095e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.095e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 JAK2-204ENST00000636127 2615 ntTSL 514.41□□□□□ -0.15e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 CXorf40B-204ENST00000370409 1129 ntTSL 514.07□□□□□ -0.165e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.165e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.185e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.215e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.225e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.245e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.245e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.255e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.262e-9■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.275e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 ATP9B-207ENST00000586672 583 ntTSL 413.3□□□□□ -0.285e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 FAM171A2-203ENST00000589407 1066 ntTSL 313.21□□□□□ -0.295e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.35e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 CERCAM-205ENST00000420512 887 ntTSL 313.07□□□□□ -0.325e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 ACSS2-215ENST00000481971 570 ntTSL 413.03□□□□□ -0.325e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 ADGRE5-207ENST00000587535 931 ntTSL 312.92□□□□□ -0.345e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 CAMKK2-205ENST00000392474 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.415e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 ADGRE5-214ENST00000592261 573 ntTSL 412.42□□□□□ -0.425e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.455e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 CFL1-213ENST00000532134 855 ntTSL 512.23□□□□□ -0.455e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 ACSS2-209ENST00000475459 558 ntTSL 412.11□□□□□ -0.475e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 CXorf40B-203ENST00000370406 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.535e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 ADGRE5-211ENST00000591080 554 ntTSL 411.74□□□□□ -0.535e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 ADGRE5-203ENST00000358600 2751 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.555e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 MANBA-201ENST00000226578 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.65e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 FRMD8-204ENST00000525156 380 ntTSL 511.21□□□□□ -0.615e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 ADGRE5-202ENST00000357355 3054 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.625e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 CXorf40B-201ENST00000355203 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.645e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 ADGRE5-204ENST00000586517 578 ntTSL 410.82□□□□□ -0.685e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 LINC01238-203ENST00000429456 2170 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.75e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 C14orf159-224ENST00000522816 827 ntTSL 1 (best)10.56□□□□□ -0.725e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 NOC2L-203ENST00000477976 4201 ntTSL 510.55□□□□□ -0.725e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 CAMKK2-216ENST00000545538 3797 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.735e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 CERCAM-211ENST00000487001 553 ntTSL 510.48□□□□□ -0.735e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 ADGRE5-201ENST00000242786 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.765e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 TERF2IP-202ENST00000564671 1266 ntTSL 210.23□□□□□ -0.775e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 AC091976.1-204ENST00000503504 492 ntTSL 510.22□□□□□ -0.775e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 ACSS2-206ENST00000468550 547 ntTSL 510.08□□□□□ -0.85e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 RRM1-209ENST00000531591 639 ntTSL 29.65□□□□□ -0.865e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 ACSS2-217ENST00000488172 648 ntTSL 49.55□□□□□ -0.885e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 ADGRE5-209ENST00000587728 587 ntTSL 49.4□□□□□ -0.95e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 INPP5A-201ENST00000342652 832 ntTSL 59.39□□□□□ -0.911e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 AL662884.1-201ENST00000559458 662 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.935e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 ACSS2-214ENST00000481284 2851 ntTSL 29.2□□□□□ -0.945e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 ZNF253-204ENST00000592725 820 ntTSL 28.94□□□□□ -0.985e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 ADGRE5-208ENST00000587606 572 ntTSL 28.85□□□□□ -0.995e-6■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 BCL9L-204ENST00000530293 445 ntTSL 58.61□□□□□ -1.032e-9■■■■□ 21
CSTF2TQ9H0L4 CERCAM-210ENST00000483893 587 ntTSL 48.61□□□□□ -1.035e-6■■■■□ 21
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