Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
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