Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms