Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2OQ9C0C9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2OQ9C0C9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2OQ9C0C9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2OQ9C0C9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2OQ9C0C9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2OQ9C0C9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2OQ9C0C9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2OQ9C0C9 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2OQ9C0C9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2OQ9C0C9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2OQ9C0C9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2OQ9C0C9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2OQ9C0C9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms