Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRIM4Q9C037 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM4Q9C037 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms