Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMES1Q9C002 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms