Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
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