Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE4

GTPBP4, Nucleolar GTP-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP4Q9BZE4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP4Q9BZE4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GTPBP4Q9BZE4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTPBP4Q9BZE4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTPBP4Q9BZE4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTPBP4Q9BZE4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTPBP4Q9BZE4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms