Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYW2

SETD2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD2Q9BYW2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SETD2Q9BYW2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SETD2Q9BYW2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SETD2Q9BYW2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SETD2Q9BYW2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SETD2Q9BYW2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SETD2Q9BYW2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SETD2Q9BYW2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms