Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY50

SEC11C, Signal peptidase complex catalytic subunit SEC11C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC11CQ9BY50 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEC11CQ9BY50 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms