Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXM0

PRX, Periaxin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRXQ9BXM0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PRXQ9BXM0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PRXQ9BXM0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PRXQ9BXM0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PRXQ9BXM0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
PRXQ9BXM0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PRXQ9BXM0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PRXQ9BXM0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PRXQ9BXM0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PRXQ9BXM0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PRXQ9BXM0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PRXQ9BXM0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PRXQ9BXM0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
PRXQ9BXM0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PRXQ9BXM0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PRXQ9BXM0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PRXQ9BXM0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PRXQ9BXM0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PRXQ9BXM0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PRXQ9BXM0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PRXQ9BXM0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PRXQ9BXM0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PRXQ9BXM0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PRXQ9BXM0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PRXQ9BXM0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PRXQ9BXM0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms