Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms