Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms