Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COPS4Q9BT78 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 272.3 ms