Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOXF2Q9BQY4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms