Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LPIN3Q9BQK8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LPIN3Q9BQK8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LPIN3Q9BQK8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LPIN3Q9BQK8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LPIN3Q9BQK8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LPIN3Q9BQK8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LPIN3Q9BQK8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LPIN3Q9BQK8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LPIN3Q9BQK8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LPIN3Q9BQK8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LPIN3Q9BQK8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LPIN3Q9BQK8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LPIN3Q9BQK8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LPIN3Q9BQK8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LPIN3Q9BQK8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LPIN3Q9BQK8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LPIN3Q9BQK8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LPIN3Q9BQK8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LPIN3Q9BQK8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LPIN3Q9BQK8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LPIN3Q9BQK8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LPIN3Q9BQK8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LPIN3Q9BQK8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LPIN3Q9BQK8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LPIN3Q9BQK8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LPIN3Q9BQK8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LPIN3Q9BQK8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LPIN3Q9BQK8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms