Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPOCK3Q9BQ16 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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