Protein–RNA interactions for Protein: Q99959

PKP2, Plakophilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP2Q99959 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKP2Q99959 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms