Protein–RNA interactions for Protein: Q99496

RNF2, E3 ubiquitin-protein ligase RING2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF2Q99496 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF2Q99496 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms